VIASURE Real Time PCR Detection Kits
Norovirus GI
Descripción
VIASURE Norovirus GI Real Time PCR Detection Kit está diseñado para la identificación específica de Norovirus GI en muestras de heces humanas procedentes de pacientes con signos y síntomas de infección gastrointestinal.
El uso previsto del test es facilitar el diagnóstico de infección producida por Norovirus GI en seres humanos en combinación con factores de riesgos clínicos y epidemiológicos. El RNA es extraído a partir de las muestras fecales, posteriormente el DNA complementario es sintetizado en un solo paso y amplificado mediante PCR a tiempo real.
La detección se lleva a cabo utilizando oligonucleótidos específicos y una sonda marcada con una molécula fluorescente y otra apantalladora (quencher) para detectar Norovirus GI.
Especificaciones
Información
Norovirus (NoV) pertenece a la familia de Caliciviridae y se considera la principal causa de gastroenteritis aguda no bacteriana en todos los grupos de edad en todo el mundo.
NoVs se clasifican en seis genogrupos distintos (GIGVI) basados en el árbol filogenético inferido por la comparación de la secuencia peptídica completa de VP1. En particular, los genogrupos GI, GII y GIV infectan a los seres humanos. Además, los genogrupos se dividen en genotipos definidos en base a las secuencias de la RNA polimerasa y/o de la proteína de la cápside VP1. Hasta la fecha, en base al análisis filogenético de la secuencia de la cápside se han reconocido nueve genotipos en el genogrupo GI y veintidós en el GII, y solamente se han detectado tres genotipos del GII (GII.11, GII.18 y GII.19) en cerdos.
Tras un período de incubación de 12 a 48 h, la enfermedad causada por norovirus se caracteriza por vómitos en proyectil, diarrea sin sangre, náuseas, calambres abdominales y fiebre de bajo grado. Los norovirus pueden infectar a los humanos a través de múltiples vías, incluyendo la vía oral, transmitida a través del contacto con la
materia fecal, o por aerosolización de los vómitos de las personas infectadas, así como las superficies contaminadas, los alimentos o el agua.
El genoma de norovirus consiste en un RNA monocatenario de sentido positivo de 7.5-kb que contiene tres marcos de lectura abierta (ORFs). El ORF1 codifica un polipéptido de seis proteínas no estructurales, incluyendo la RNA-polimerasa dependiente de RNA (RdRp), el ORF2 codifica la proteína principal de la cápside, VP1, mientras que el ORF3 codifica la proteína estructural menor de la cápside, VP2. La mayoría de los ensayos de RTPCR en tiempo real para norovirus GI y GII van dirigidos a región de unión de la RNA polimerasa y la cápside
(ORF1-ORF2 junction), que es la región del genoma de norovirus más altamente conservada.