VIASURE Real Time PCR Detection Kits
Sapovirus
Descripción
VIASURE Sapovirus Real Time PCR Detection Kit está diseñado para la identificación específica de Sapovirus en muestras de heces humanas procedentes de pacientes con signos y síntomas de infección gastrointestinal.
El uso previsto del test es facilitar el diagnóstico de infección producida por Sapovirus en seres humanos en combinación con factores de riesgos clínicos y epidemiológicos.
El RNA es extraído a partir de las muestras fecales, posteriormente el DNA complementario es sintetizado en un solo paso y amplificado mediante PCR a tiempo real. La detección se lleva a cabo utilizando oligonucleótidos específicos y una sonda marcada con una molécula fluorescente y otra apantalladora (quencher) para detectar Sapovirus.
Especificaciones
Información
Los Sapovirus (SaV), anteriormente conocidos como «virus Sapporo-like,» pertenecen a la familia Caliciviridae y causan gastroenteritis aguda en humanos y ganado porcino. Estos virus fueron detectados por primera vez en 1977, como la causa de un brote de gastroenteritis en un orfanato en Sapporo (Japón), y desde entonces, se han descrito 15 genotipos agrupados en cuatro genogrupos (GI.1 a GI.8, GII.1 a GII.5, GIV, y GV) en los seres humanos.
SaV se considera una causa importante de gastroenteritis en niños menores de 5 años de edad, mientras que en los adultos su importancia es menor. Los síntomas clínicos de infección por sapovirus se cree que son más leves que los síntomas asociados con norovirus, que incluyen heces acuosas, diarrea suave o aguda, calambres en el estómago, náuseas, vómitos y ocasionalmente fiebre. SaVs se pueden transmitir a través de la vía fecal-oral a partir de agua y alimentos contaminados, así como a través del contacto de persona a persona.
El genoma SaV consiste en un RNA monocatenario de sentido positivo (ssRNA+) de 7.5-kb que contiene dos ó tres open reading frames (ORFs). El ORF1 codifica para las proteínas no estructurales (incluyendo la RNApolimerasa dependiente de RNA) y para la proteína mayoritaria de la cápside (VP1). El ORF2 codifica para una proteína estructural minoritaria y el ORF3 para una proteína de función todavía desconocida. Actualmente, los ensayos basados en RT-PCR a Tiempo Real más utilizados van dirigidos a detectar la región situada en el extremo 3’ de la región codificante para la RNA polimerasa dependiente de RNA, ya que es una de las regiones más conservadas en el genoma de SaV.