VIASURE West Nile Virus Real Time PCR Detection Kit está diseñado para la identificación específica del virus West Nile en muestras clínicas procedentes de pacientes con signos y síntomas de infección por virus West Nile.

El uso previsto del test es facilitar el diagnóstico de infección producida por el virus West Nile en combinación con factores de riesgos clínicos y epidemiológicos.

El RNA es extraído a partir de las muestras clínicas, posteriormente el DNA complementario es sintetizado en un solo paso y amplificado mediante PCR a tiempo real. La detección se lleva a cabo utilizando oligonucleótidos específicos y una sonda marcada con una molécula fluorescente y otra apantalladora (quencher) para detectar virus West Nile.

Desde que se aislara inicialmente en Uganda en 1937 hasta ahora, el virus del Nilo occidental (West Nile Virus, WNV) se ha propagado a una vasta región del mundo y hoy en día se considera el patógeno zoonótico causal más importante de encefalitis viral en todo el mundo. WNV pertenece al género Flavivirus y al serocomplejo de la encefalitis japonesa. El análisis filogenético ha revelado dos principales linajes de virus del Nilo Occidental, el linaje 1, ampliamente distribuido, el cual se subdivide en tres subtipos (A, B y C) y el linaje 2. Si bien, durante los últimos años se han sugerido varios linajes adicionales.

En la naturaleza, hay un ciclo de transmisión enzoótica del virus del Nilo Occidental entre las aves (huéspedes) y los mosquitos (vectores puente) del género Culex (principalmente Cx. pipiens, Cx. perexiguus y Cx. modestus) y Aedes. Sin embargo este virus puede infectar otros vertebrados y a los seres humanos, entre los cuales se han reportado otros métodos de transmisión adicionales: transfusión de sangre, trasplante de órganos, la transmisión transplacentaria y a través de la leche materna. La mayoría de las infecciones humanas con virus del Nilo Occidental (~80%) son asintomáticas o se caracterizan por un cuadro clínico similar a la gripe y leve malestar febril. Sin embargo, en menos de un 1% la infección puede progresar a una enfermedad neuroinvasiva más grave (WNND) e incluso la muerte, dependiendo de la respuesta inmune del huésped y de la cepa viral. WNND abarca a su vez tres síndromes diferentes: encefalitis, meningitis y parálisis flácida aguda.

El Virus del Nilo Occidental tiene un genoma de RNA de sentido positivo que codifica una sola poliproteína que es co- y post-traduccionalmente escindida en 3 proteínas estructurales y en 7 no estructurales. El diagnóstico de laboratorio se realiza generalmente mediante pruebas serológicas a partir de suero o líquido cefalorraquídeo (LCR) para detectar anticuerpos IgM específicos de WNV y se confirma mediante pruebas de neutralización por reducción de placas (PRNTs). Sin embargo, la reactividad cruzada con las infecciones causadas por otros flavivirus sigue siendo el principal problema de los test de diagnóstico serológicos. A este respecto, diferentes protocolos basados en PCR se han desarrollado para detectar el RNA viral. Para realizar estas pruebas podemos partir de muestras de suero y LCR, recogidas durante el curso temprano de la enfermedad, así como muestras de tejidos adicionales como la orina, donde se puede detectar durante mucho más tiempo y en concentraciones más altas.